تبلیغات
مهندسی داروسازی +pharmaceutical engineering - آموزش نرم افزار و انجام پروژه 1

کلید موفقیت : تلاش+برنامه ریزی +پشت کار

آموزش نرم افزار و انجام پروژه 1

نویسنده :یوسفی +09187135911
تاریخ:دوشنبه 5 اسفند 1392-09:29 ب.ظ

جهت آموزش مطالب و نرم افزارهای زیر درخواست خود را  به آدرس jabneg@gmail.com ایمیل نمایید.

شبیه سازی و دینامیک مولکولی

سر فصل ها:

1-     آموزش مبانی دینامیک مولکولی

·        انواع میدان های نیرو و مقایسه آن ها

میدان های نیرو و موارد کاربرد آن‌ها

مخفف میدان نیرو

میدان نیرو

میدان  نیروی کلاسیک

AMBER

Assisted Model Building and Energy Refinement

CHARMM

Chemistry at HARvard Molecular Mechanics

CVFF

consistent-valence forcefield

GROMOS

GROningen MOlecular Simulation package

OPLS 

Optimized Potential for Liquid Simulations)

UFF

Universal force field

میدان نیروی نسل دوم

CFF

Consistent Force Field

COMPASS

Condensed-phase Optimized Molecular Potentials for Atomistic Simulation Studies

PCFF

polymer consistent forcefield

MMFF 

Merck Molecular Force Field

 

·        بهینه سازی ساختار مولکول

·        هنگرد های موجود برای به تعادل رساندن سیستم

انواع روش های کوپل دما و فشار

روش کوپل دما

Velocity scale

Nose-Hoover

Anderson

Berendsen

روش کوپل فشار

Parrinello-Rahman

 

Andersen

 

·        نحوه به دست آوردن تابع توزیع شعاعی و تحلیل آن

·        موارد استفاده از تابع توزیع شعاعی

·        به دست آوردن MSD

 

2-     آموزش نرم افزار Material Studio

·        نحوه ترسیم ساختار

·        ایجاد جعبه مورد نظر برای شبیه سازی

·        تنظیم دما و فشار (مرحله تعادل)

·        مرحله تولید یا production phase

·        آنالیز نتایج شامل:

-         تعیین پروفایل غلظت در ابعاد مختلف هنگرد

-         تعیین دانسیته سیستم

-         به دست آوردن MSD

-         پروفایل فشار

-         تابع توزیع شعاعی (RDF or PCF)

-          Radious of gyration

-         توزیع دما، انرژی های بین مولکولی و درون مولکولی و سرعت

-         به دست آوردن عدد کئوردیناسیون

-         به دست آوردن مقدار انتگرال کرک-باف




داغ کن - کلوب دات کام
نظرات() 
BHW
پنجشنبه 24 فروردین 1396 12:51 ق.ظ
Wow, superb blog layout! How long have you been blogging for?
you made blogging look easy. The overall look of your web site is wonderful,
as well as the content!
manicure
شنبه 19 فروردین 1396 07:37 ق.ظ
Hello there, I think your blog might be having internet browser compatibility issues.
Whenever I look at your blog in Safari, it looks fine but when opening in IE, it's got some overlapping
issues. I simply wanted to provide you with a quick
heads up! Besides that, excellent site!
manicure
سه شنبه 15 فروردین 1396 12:04 ق.ظ
I was wondering if you ever thought of changing the layout of your
blog? Its very well written; I love what youve got to say.
But maybe you could a little more in the way of content so
people could connect with it better. Youve got an awful lot of text for only having one or 2 images.

Maybe you could space it out better?
 
لبخندناراحتچشمک
نیشخندبغلسوال
قلبخجالتزبان
ماچتعجبعصبانی
عینکشیطانگریه
خندهقهقههخداحافظ
سبزقهرهورا
دستگلتفکر




Admin Logo
themebox Logo