تبلیغات
مهندسی داروسازی +pharmaceutical engineering - انجام پروژه های QSAR، GQSAR و شیمی محاسباتی

کلید موفقیت : تلاش+برنامه ریزی +پشت کار

انجام پروژه های QSAR، GQSAR و شیمی محاسباتی

نویسنده :یوسفی +09187135911
تاریخ:جمعه 15 شهریور 1392-04:39 ب.ظ

زمینه پروژه های انجام شده QSAR و GQSAR به صورت 2D و 3D در جدول زیر آورده شده است:

روش انتخاب متغیر

روش رگرسیون

Stepwise (forward-backward)

Multiple Linear Regression (MLR)

Genetic Algorithm (GA)

Simulated Annealing (SA)

Stepwise (forward-backward)

Principle Component Regression (PCR)

Genetic Algorithm (GA)

Simulated Annealing (SA)

Stepwise (forward-backward)

Partial Least Square (PLS)

Genetic Algorithm (GA)

Simulated Annealing (SA)


در روش GQSAR مولکولی پیشنهاد می شود که احتمالاً فعالیت بیولوژیکی بهتری دارد و می توان این مولکول را سنتز کرد و این همان چیزی است که QSAR به دنبال آن است.

برای انجام پروژه در صورت تمایل از روش های پیشرفته مثل شبکه مصنوعی و ... نیز استفاده خواهد شد.

زمینه های دیگر که توانایی انجام پروژه در آن ها وجود دارد در زیر با توضیح مختصر آورده شده است:

آنالیز کانفورماسیون مولکول به دو روش systemic و Monte Carlo: آنالیز کانفورماسیون در تولید کانفورماسیون های احتمالی یک مولکول بسیار مهم می باشد و در اپتیمایزیشن ساختار یک مولکول مهمم است زیرا انرژی پتانسیل یک مولکول تابع غیر خطی می باشد که در آن پیدا کردن نقطه بهینه کل بسیار مشکل می باشد و بستگی به نقطه اولیه شروع (کانفورمر اول) و روش بهینه سازی دارد. کانفورمرهای ایجاد شده هر کدام می توانند به عنوان نقطه اولیه شروع باشند تا اینکه پایدارترین حالت مولکول پیدا شود.

 Comparative Binding Energy analysis (COMBINE): نتایج این قسمت می تواند در طراحی بهتر لیگاند مفید باشد.

محاسبه توصیف گرهای یک مولکول که شناسنامه یک مولکول و پایه و اساس QSAR و GQSAR
می باشد.

انجام محاسبات 2DQSAR ، 3DQSAR، 2DGQSAR و 3DQSAR با روش های پیشرفته رگرسیون

مطالعات فارماکوفور: در ساختار شیمیایی دارو به حداقل نیاز ساختمانی که دارویی باید داشته باشد تا اثر خود را اعمال کند pharmacophore دارو گویند که برای مطالعات SARضروری است. با دانستن فارماکوفور می توانیم روی potency و selectivity دارو تاثیر بگذاریم.

تولید آرشیوی از مولکول های ترکیبی بالقوه (combinatorial virtual library of molecules): یکی از مهمترین اهداف شیمی دارویی یافتن ترکیب مادر (lead compound =L.C) در هر دسته دارویی است. ترکیبی است که اثر فارماکولوژیک دارد اما ایده ال نیست. در صورتی تبدیل به DRUG می شود که نکات مثبت تقویت و معایب از بین برود. برای اینکه به یک مولکولی دست پیدا کنیم که به عنوان بهترین دارو شناخته شود باید به صورت تجربی تمامی مشتقات مولکول را سنتز کنیم که کاری دشوار و هزینه بر است. امروزه برای این کار توسط نرم افزار یک آرشیوی از ترکیبات احتمالی ایجاد می شود که ابتدا توسط قانون Lipinski غربال گیری می شوند تا به ترکیب محتمل نزدیک شویم. توانمندی های این قسمت شامل:

 

Generate a combinatorial library

Generate a combinatorial library with filters

Analyze the generated combinatorial library

بهینه سازی ساختار مولکول

Protein complex optimization: تکنیکی برای molecular docking

protein analysis: برای آنالیز نمودار Ramchandran، آنالیز حفره و سایت فعال پروتئین

Homology modeling

 --------------------------------------------------------------------------------------------------

دوستانی که در زمینه های بالا پروژه دارند می توانند درخواست خود را به آدرس jabneg@gmail.com ارسال نمایند. 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 




داغ کن - کلوب دات کام
نظرات() 
هاشم قاسمی زاده
پنجشنبه 16 مرداد 1393 11:26 ب.ظ
با سلام وخسته نباشید
سوالی خدمتتون دارم من کارشناسی مهندسی شیمی گرایش طراحی فرایند دارم و الان پرسنل شبکه بهداشت و درمان هستم ولی ردیفم بهورز هست میتونم درخواست فعالیت در شرکت های داروسازی بدهم خیلی ممنون اگه راهنمایی کنید
پاسخ یوسفی +09187135911 : با سلام

شما می توانید در شرکت های تولید کننده ماده اولیه دارویی فعالیت داشته باشید که می توانید درخواست خود را به این شرکت ها ارسال نمایید.
 
لبخندناراحتچشمک
نیشخندبغلسوال
قلبخجالتزبان
ماچتعجبعصبانی
عینکشیطانگریه
خندهقهقههخداحافظ
سبزقهرهورا
دستگلتفکر




Admin Logo
themebox Logo